A mon avis le plus simple est d'installer les paquets ssh-client et ssh-server, et de transférer avec scp.
Exemple:
tu veux transférer le repertoire /home/francis du pc1 vers le pc2 (le mieux est de créer un user temporaire sur le pc2 pour qu'il n'y ai pas déja francis).
Sur le pc1 => cd /home
puis => scp -r francis
root@192.168.1.2:/home
la le programme va te demander le mot de passe, c'est celui de root du pc2 qu'il faut donner.
PS. j'ai supposé que l'ip du pc2 est 192.168.1.2 ...